藏医学是以藏族为主创造发展起来的传统医学，也是中国传统医学的重要组成部分，已有2000多年的历史。约公元前1世纪，藏族人民就懂得了采食野果、野菜以消除疼痛，并用马宝解治食物中毒。

8世纪初，藏医第一部综合性医书《月牙药诊》问世。8世纪末，著名藏医学家宇陀·云丹贡布编撰的藏医学经典著作《四部医典》的问世，标志着藏医从此走上成熟发展的轨道。藏医认为产生疾病的原因不外乎内、外因两种，内因是隆赤培3元素的失调；外因包括气候变化、起居不适、饮食不洁、外伤等。藏医记载的疾病有404种，其诊断方法与西医学体系不相同，其中尿诊最具特色，治疗疾病的方法很丰富：内治法以饮食及药物为主，强调根据季节调整饮食起居；外治包括针剌放血、按摩、外擦、火灸、拔罐、药熏、敷烫、药水浴、穿剌等。

藏医所用的药物剂型多用丸、膏、散剂，丸剂又有水丸、密丸、还有具有民族特色的酥油丸。其中“珍珠七十”、常觉、芒觉、坐珠达西等名贵药物在国内外获奖，饮誉四方，对高原疾病，消化系统、皮肤、脑溢血等慢性疑难杂症，具有独特的疗效。

藏医对胚胎学方面的贡献在世界医学界享有盛誉。藏医胚胎学最迟形成于公元6世纪，比现代医学胚胎解剖学早了近千年。藏医认识到人胚是由父精母血结合而成，同时指出胚胎发育过程中，要经历鱼（水生动物）、兔（爬行动物）、猪（哺乳动物）3个发育阶段，其对胚胎学的形象描述，准确地描述了动物进化的经历，是高等动物进化史的一个缩影，对我国医学乃至世界医学都是一大贡献。此外，1703年第司·桑结嘉措主持绘制了80幅《四部医典》彩色挂图，把深澳的藏医更加直观明了，这是在世界医学界实属罕见的创举。